微生物菌落成像一定要先把菌分离吗？

不必。MSI 可在原位呈现菌群及其代谢产物的空间分布，无需把菌从基质完全分离，减少前处理偏差。

微生物 MSI 能到单细胞尺度吗？

DPI 在 20–200 μm 区间；新策源 MSI LDPI 提供 2–3 μm 免标记常压成像，可进入单细胞/亚细胞尺度。

因培养基、组织等基质复杂，基质峰会干扰低质量区；DPI、LDPI 免基质，复杂样品直接上机。

建议与培养、测序、色谱-质谱等互补方法交叉验证；MSI 主要提供菌群化学空间维度证据。

应用实例 · 质谱成像

微生物从不孤立存在，它们的代谢产物、相互作用都藏在空间里。微生物菌落成像，用质谱成像（MSI）在培养基或组织上逐点采集，原位呈现菌群、单细胞及其代谢产物的空间分布，使研究者能在「不分离」的前提下读懂菌群的化学指纹。

本文目录
一、MSI 在微生物研究中的切入点二、能解决哪些微生物问题三、与单细胞、亚细胞成像的衔接四、解读边界与互补方法

微生物菌落成像：把「一片菌落」看成化学地图示意图

新策源 MSI DPI 的应用说明把细菌分析、微生物成像、微生物生态学纳入病理学诊断相关方向，也覆盖毒理学、环境化学等交叉领域。MSI 的优势是无需把菌群从基质中完全分离，即可在原位呈现其分子与代谢产物分布。

其免基质、离子抑制低、复杂样品直接上机的特性，使含培养基、组织等复杂基质的微生物样本可较直接地上机成像，减少前处理引入的偏差。

一是菌群空间结构：不同菌在 colony 或组织中的分布位置；二是代谢互作：哪些代谢产物在菌间或菌-宿主界面富集；三是感染定位：感染或菌群相关样本的分子分布特征；四是快速筛查：对食品、环境样本中的微生物及其产物做高通量成像。

新策源 MSI DPI 支持高通量快速分析与筛选，将中药材、血液、天然产物、药物等列为典型对象，其免前处理取向同样利好微生物样本的即取即测。

当分辨率推进到单细胞乃至亚细胞尺度，MSI 可在单个微生物细胞层面读取其化学组成。新策源 MSI LDPI 提供 2–3 μm 免标记常压成像，可进入单细胞/亚细胞尺度，与 DPI 的 20–200 μm 区间互补，支撑更精细的微生物空间研究。

工程上，DPI 适配 Agilent / AB SCIEX / Thermo 主流质谱主机，提供自研钛合金离子传输管、前端不损伤样品、可拆洗维护，使微生物成像能够稳定、可重复地开展。

微生物 MSI 仍面临基质干扰、谱图注释、定量校准等挑战，结论宜结合培养、测序、色谱-质谱等互补方法交叉验证。MSI 的核心价值在于提供「菌群化学空间分布」这一维度。

从产业视角看，免前处理、即装即用、长期稳定运行的工程取向，正把这类高门槛的微生物分析逐步推向常规检测室。

微生物菌落成像一定要先把菌分离吗？: 不必。MSI 可在原位呈现菌群及其代谢产物的空间分布，无需把菌从基质完全分离，减少前处理偏差。
微生物 MSI 能到单细胞尺度吗？: DPI 在 20–200 μm 区间；新策源 MSI LDPI 提供 2–3 μm 免标记常压成像，可进入单细胞/亚细胞尺度。
为什么微生物成像看重免基质？: 因培养基、组织等基质复杂，基质峰会干扰低质量区；DPI、LDPI 免基质，复杂样品直接上机。
微生物菌落成像能单独下结论吗？: 建议与培养、测序、色谱-质谱等互补方法交叉验证；MSI 主要提供菌群化学空间维度证据。

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