很多生物学问题本质是空间问题：为什么某蛋白只在瘤区高表达？为什么修饰状态在边缘带不同？传统蛋白质组学匀浆测平均量，抹平了这些差异。蛋白质成像用 MSI 或空间蛋白质组学流程保留结构，直接呈现蛋白/肽的空间异质性。
在新策源产品体系中，MSI 成像源（DPI、LDPI）提供的是「分子—坐标」的原位采集能力；蛋白质成像可借由相应前处理（如酶解、基质或免基质路线）把蛋白信息转化为可成像的肽/离子信号。
MSI 可原位呈现多肽、蛋白相关离子及修饰特征的空间分布；新策源 MSI DPI 免基质、离子抑制低、复杂样品直接上机，20–200 μm 分辨率可调，适配需在组织上定位蛋白相关信号的研究。
更高空间分辨率需求（如蛋白是否定位于某一细胞带或亚细胞结构）可由新策源 MSI LDPI 的 2–3 μm 免标记常压成像补充，覆盖从器官到单细胞/亚细胞的不同尺度。
蛋白质成像常需酶解等前处理把蛋白转化为可测离子，并配合基质或免基质路线。结果需与免疫荧光、免疫组化、Western 等验证手段配准，确认信号是否落在预期组织学结构。新策源两款成像源成像后切片保持完整，可继续 H&E 或免疫组化验证。
免前处理的工程价值在此凸显：DPI、LDPI 免基质、即取即测，把样品处理从「半天起步」压到「即取即测」，对需要大量样本对比的蛋白质空间研究显著提速。
蛋白质 MSI 仍面临前处理复杂、离子化效率差异、定量校准等挑战，结论宜结合免疫学、转录组、代谢组等互补方法交叉验证。空间蛋白质组常与空间代谢组、空间脂质组联合，形成多组学整合成像。
工程上，新策源两款成像源适配 Agilent / AB SCIEX / Thermo 主流质谱主机，提供自研钛合金离子传输管、前端不损伤样品、可拆洗维护，为蛋白质成像研究的稳定可重复开展提供支撑。
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