SCiLS Lab 将逐点采集的成像谱重建为离子图(ion image),支持伪彩、叠加、谱图提取与区域 ROI 统计。用户可在组织形态上直接读取分子空间分布与相对强度。
其统计模块支持区域间比较、差异离子筛选与基本分类,帮助从描述性成像推进到组间差异分析,衔接空间生物学与临床诊断探索。
软件可导入 MALDI(含透射模式、AP-SMALDI)、DESI、LDPI 等源产生的数据,并以标准格式(imzML)交换。对常压免基质源(LDPI/DPI)的数据,同样按 m/z 重建离子图与统计。
多样本管理能力使其适合队列研究:可将多个组织切片对齐到共同坐标框架,进行批次比较与一致特征提取。
SCiLS Lab 通常处于成像链的“数据后处理”环节:前端由成像源采集,后端由软件完成注释、可视化与统计,结果可与 H&E/IHC 形态图像配准。
它与 MetaboScape、MSiReader 功能互补,均在 imzML 生态内交换数据;选型取决于平台绑定、统计深度与用户习惯。
若已在 MALDI 生态或使用配套厂商平台,SCiLS Lab 是顺滑选择;若使用 Orbitrap/Q-TOF 等其他分析器,需确认导入兼容性。对免基质常压成像(LDPI/DPI)用户,以 imzML 兼容为优先确保数据可被处理。
建议将软件纳入标准成像 SOP:统一格式导出、统一配准流程,以保证多项目间结果可比。
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