典型流程为:迅速取材并固定(冷冻或化学固定)以锁定原位分布 → 切片(冷冻切片为主)暴露截面 → 按需做基质喷涂(MALDI)或导电处理(真空源)→ 上机成像。免基质常压源(LDPI、DPI、DESI)可省去基质喷涂,缩短链路。
每一步都可能引入分子迁移、降解或伪影,因此流程设计的目标是“最少扰动 + 最大保真”,并在可操作性(如后续 H&E/IHC 注释)间平衡。
核心控制包括:取材速度(减少死后变化)、固定方式(冷冻利于小分子,化学固定利于形态)、切片厚度与温度、以及前处理均匀性(基质喷涂均匀、导电完整)。任一失控都会在图像中体现为伪影或偏差。
对小分子与代谢物,尤其要抑制冰晶损伤与解冻迁移;对蛋白/肽,则要防止酶解。控制点应量化并可审计。
质谱成像跨样本、跨项目的可比性高度依赖统一前处理。建立标准 SOP(统一试剂、参数、操作与质控节点)能将人为波动降至最低,是队列研究与可复现科学的前提。
SOP 还应规定数据导出格式(如 imzML)与配准流程,使前端制备与后端分析无缝衔接。
不同源对制备要求不同:MALDI 需基质喷涂,TOF-SIMS 需导电载玻片,LDPI/DPI/DESI 免基质常压、制备最轻。制备方案应随所选源调整,而非一刀切。
对新建免基质常压成像线,推荐“冷冻切片→直接采样”的短链路 SOP,以最大化保留原位分子信息。
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